这是发展Affylmgui的版本;对于稳定版本,请参阅affylmgui。
生物导体版本:开发(3.16)
使用Affy和Limma软件包分析Affymetrix微阵列基因表达数据的图形用户界面(GUI)。
作者:James Wettenhall [CRE,AUT],Gordon Smyth [AUT],Ken Simpson [aut],Keith Satterley [CTB]
维护者:gordon smyth
引用(从r内,输入引用(“ affylmgui”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ affylmgui”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ affylmgui”)
html | 大约.html | |
R脚本 | Affylmgui小插图 | |
html | custmenu.html | |
从affylmgui文件中提取affy和limma对象 | ||
html | index.html | |
html | WindowsFocus.html | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 批处理效应,,,,贝叶斯,,,,DataImport,,,,差异性,,,,GUI,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,正常化,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,专有Platratforms,,,,QualityControl,,,,回归,,,,软件,,,,时间科,,,,转录,,,,Mrnamicroarray |
版本 | 1.71.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 17年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | Grdevices,图形,统计,UTILS,TCLTK,TKRPLOT,,,,林玛,,,,副词,,,,affyio,,,,affyplm,,,,GCRMA,,,,生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,生物管理器,,,,R2HTML,,,,Xtable |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://bioinf.wehi.edu.au/affylmgui/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Affylmgui_1.71.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | Affylmgui_1.71.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affylmgui |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/affylmgui |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/affylmgui/ |
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