AirPart

doi：10.18129/b9.bioc.airpart

这是发展AirPart的版本；对于稳定版本，请参阅AirPart。

差异细胞类型特异性等位基因失衡

生物导体版本：开发（3.16）

AirPart使用单细胞等位基因计数，识别出在细胞类型或状态之间显示差异细胞类型的等位基因失衡的基因集。它利用了普遍的融合拉索，并通过对等位基因失衡来划分细胞类型的二项式观察。另外，提供了用于分区细胞类型的非参数方法。该软件包包括许多可视化和质量控制功能，用于检查单细胞等位基因不平衡数据集。

作者：Wancen MU [AUT，CRE]，迈克尔·洛夫[AUT，CTB]

维护者：wancen Mu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ airpart”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ AirPart”）

html	R脚本	AirPart的差分等位基因失衡
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	Atacseq，，，，细胞生物学，，，，chipseq，，，，聚类，，，，差异性，，，，功能基因组学，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，GraphandNetwork，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，回归，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录，，，，转录组变量
版本	1.5.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	GPL-2
要看	R（> = 4.1）
进口	Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，S4VECTORS，，，，评分，统计蓝精灵，，，，apeglm（> = 1.13.3），emdbook，，，，mclust，，，，线索，，，，DynamiCtreCut，，，，矩阵，，，，dplyr，，，，plyr，，，，GGPLOT2，，，，复杂的图像，，，，森林图，，，，rcolorbrewer，，，，rlang，，，，lpsold，网格，grdevices，图形，utils，pbapply
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，roxygen2（> = 6.0.0），测试（> = 3.0.0），GPLOTS，，，，花花公子
系统要求
增强
URL	https://github.com/wancen/airpart
BugReports	https://github.com/wancen/airpart/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	airpart_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	airpart_1.5.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	airpart_1.5.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/airpart
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/airpart
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/airpart/
软件包下载报告	下载统计