这是发展ALEVINQC的版本;对于稳定版本,请参阅ALEVINQC。
生物导体版本:开发(3.16)
生成QC报告总结了Alevin运行的输出。报告可以作为HTML或PDF文件或闪亮的应用程序生成。
作者:Charlotte Soneson [Aut,CRE],Avi Srivastava [aut],Rob Patro [aut],Dongze He [aut]
维护者:charlotte soneson
引用(从r内,输入引用(“ Alevinqc”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ ALEVINQC”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Alevinqc”)
html | R脚本 | ALEVINQC |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | QualityControl,,,,Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.13.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(3年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | rmarkDown(> = 2.5),工具,方法,GGPLOT2,,,,ggally,,,,dplyr,,,,rjson,,,,闪亮的,,,,发光的dashboard,,,,DT,统计,utils,tximport(> = 1.17.4),牛仔图,,,,rlang,,,,RCPP |
链接 | RCPP |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,测试(> = 3.0.0),生物管理器 |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | |
URL | https://github.com/csoneson/alevinqc |
BugReports | https://github.com/csoneson/alevinqc/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Alevinqc_1.13.1.tar.gz |
Windows二进制 | alevinqc_1.13.1.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | Alevinqc_1.13.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alevinqc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/alevinqc |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/alevinqc/ |
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