ALEVINQC

doi:10.18129/b9.bioc.alevinqc

这是发展ALEVINQC的版本;对于稳定版本,请参阅ALEVINQC

生成Alevin输出的QC报告

生物导体版本:开发(3.16)

生成QC报告总结了Alevin运行的输出。报告可以作为HTML或PDF文件或闪亮的应用程序生成。

作者:Charlotte Soneson [Aut,CRE],Avi Srivastava [aut],Rob Patro [aut],Dongze He [aut]

维护者:charlotte soneson

引用(从r内,输入引用(“ Alevinqc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ ALEVINQC”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Alevinqc”)

html R脚本 ALEVINQC
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 QualityControl,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.13.1
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(3年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 4.0)
进口 rmarkDown(> = 2.5),工具,方法,GGPLOT2,,,,ggally,,,,dplyr,,,,rjson,,,,闪亮的,,,,发光的dashboard,,,,DT,统计,utils,tximport(> = 1.17.4),牛仔图,,,,rlang,,,,RCPP
链接 RCPP
建议 尼特,,,,生物使用,,,,测试(> = 3.0.0),生物管理器
系统要求 C ++ 11
增强
URL https://github.com/csoneson/alevinqc
BugReports https://github.com/csoneson/alevinqc/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Alevinqc_1.13.1.tar.gz
Windows二进制 alevinqc_1.13.1.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) Alevinqc_1.13.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alevinqc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/alevinqc
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/alevinqc/
软件包下载报告 下载统计

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支持»

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户