这是发展Alpine的版本;对于稳定版本,请参阅高山。
生物导体版本:开发(3.16)
片段序列偏置建模和RNA-seq转录物丰度估计的校正。
作者:迈克尔·洛夫(Michael Love),拉斐尔·艾里萨里(Rafael Irizarry)
维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)
引用(从r内,输入引用(“高山”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ alpine”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Alpine”)
html | R脚本 | 高山 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 替代方案,,,,批处理效应,,,,覆盖范围,,,,差速器,,,,基因表达,,,,正常化,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化 |
版本 | 1.23.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 3.5.0) |
进口 | 生物弦,,,,iranges,,,,基因组机,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,总结性特征,,,,GenomicFeatures,,,,Speedglm,花键,图形,,,,rbgl,,,,Stringr,统计,方法,图形,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,测试,,,,降价,,,,Alpinedata,,,,rtracklayer,,,,Ensembldb,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38,,,,rcolorbrewer |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | alpine_1.23.0.tar.gz |
Windows二进制 | alpine_1.23.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | alpine_1.23.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/高山 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/alpine/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
文档»
生物导体