高山

doi:10.18129/b9.bioc.alpine

这是发展Alpine的版本;对于稳定版本,请参阅高山

高山

生物导体版本:开发(3.16)

片段序列偏置建模和RNA-seq转录物丰度估计的校正。

作者:迈克尔·洛夫(Michael Love),拉斐尔·艾里萨里(Rafael Irizarry)

维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)

引用(从r内,输入引用(“高山”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ alpine”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Alpine”)

html R脚本 高山
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,批处理效应,,,,覆盖范围,,,,差速器,,,,基因表达,,,,正常化,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化
版本 1.23.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.5.0)
进口 生物弦,,,,iranges,,,,基因组机,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,总结性特征,,,,GenomicFeatures,,,,Speedglm,花键,图形,,,,rbgl,,,,Stringr,统计,方法,图形,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,降价,,,,Alpinedata,,,,rtracklayer,,,,Ensembldb,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38,,,,rcolorbrewer
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 alpine_1.23.0.tar.gz
Windows二进制 alpine_1.23.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) alpine_1.23.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/高山
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/alpine/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户