ATSNP

doi:10.18129/b9.bioc.atsnp

这是发展ATSNP的版本;对于稳定版本,请参阅ATSNP

识别调节性SNP的亲和力测试

生物导体版本:开发(3.16)

ATSNP对基序匹配的亲和力测试与SNP或参考基因组和基序匹配中的SNP LED更改进行了亲和力测试。

作者:Chandler Zuo [AUT],Sunyoung Shin [AUT,CRE],Sunduz Keles [aut]

维护者:utdallas.edu>的sunyoung shin

引用(从r内,输入引用(“ ATSNP”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ atsnp”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ ATSNP”)

html R脚本 atsnp-vignette.html
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,基因数,,,,图案,,,,软件,,,,可视化
版本 1.13.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(3年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.6)
进口 BSGENOME,,,,Biocfilecache,,,,生物比较,,,,RCPP,,,,Data.Table,,,,GGPLOT2,grdevices,图形,网格,Motifstack,,,,Rappdirs,统计测试,utils,生命周期
链接 RCPP
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/sunyoungshin/atsnp
BugReports https://github.com/sunyoungshin/atsnp/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 atsnp_1.13.0.tar.gz
Windows二进制 atsnp_1.13.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) atsnp_1.13.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/atsnp
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/atsnp
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/atsnp/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户