这是发展Ballgown的版本;对于稳定版本,请参阅舞会礼服。
生物导体版本:开发(3.16)
用于组装转录组的统计分析工具,包括灵活的差分表达分析,转录本结构的可视化以及组装转录本与注释的匹配。
作者:Jack Fu [Aut],Alyssa C. Frazee [Aut,Cre],Leonardo Collado-Torres [Aut],Andrew E. Jaffe [Aut],Jeffrey T. Leek [Aut,THS]
维护者:JHSPH.edu> Jack Fu
引用(从r内,输入引用(“ Ballgown”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ ballgown”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Ballgown”)
html | R脚本 | 柔性同工级差异表达分析与球门 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,免疫学,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,软件,,,,统计信息 |
版本 | 2.29.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(7。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.5.0),方法 |
进口 | 基因组机(> = 1.17.25),iranges(> = 1.99.22),S4VECTORS(> = 0.9.39),rcolorbrewer,花键,SVA,,,,林玛,,,,rtracklayer(> = 1.29.25),生物酶(> = 2.25.0),GenomeInfodB |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,降价 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues |
取决于我 | vasp |
进口我 | rnaseqr |
建议我 | 聚酯纤维,,,,方差分区 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Ballgown_2.29.0.tar.gz |
Windows二进制 | ballgown_2.29.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | Ballgown_2.29.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ballgown |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/滚珠 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ballgown/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
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