banocc

DOI:10.18129 / B9.bioc.banocc

这是发展banocc版本;稳定的发布版本,请参阅banocc。

贝叶斯组合协方差分析

Bioconductor版本:发展(3.18)

BAnOCC包设计成分数据,每个样本数目。它可以近似无约束数据的协方差使用贝叶斯模型编码与“rstan”。它提供了“stanfit”作为输出对象以及后中值和可信区间估计为每个相关元素。

作者:艾玛Schwager (aut (cre),柯蒂斯Huttenhower (aut)

维护人员:乔治Weingart <乔治。柯蒂斯Huttenhower weingart gmail.com >、< chuttenh hsph.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“banocc”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“banocc”)

HTML	R脚本	BAnOCC(贝叶斯组合协方差分析)
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯,ImmunoOncology,宏基因组,软件
版本	1.25.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(6年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.5.1), rstan (> = 2.17.4)
进口	coda (> = 0.18.1)、mvtnorm stringr
链接
建议	testthat knitr、rmarkdown、方法,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	banocc_1.25.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)	banocc_1.25.0.tgz
macOS二进制(arm64)	banocc_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/banocc
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ banocc
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/banocc/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/banocc/
包下载报告	下载数据