这是发展Bayseq的版本;对于稳定版本,请参阅贝塞克。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包在高通量“计数”数据中识别差异表达,例如从下一代测序机中得出的差异表达,从经验贝叶斯方法计算差异表达(或更复杂的假设)的估计后验可能性。
作者:Thomas J. Hardcastle
维护者:thomas J. Hardcastle
引用(从r内,输入引用(“ bayseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ bayseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Bayseq”)
R脚本 | 高级Bayseq分析 | |
R脚本 | 贝塞克 | |
参考手册 |
生物浏览 | 差异性,,,,多重组合,,,,智者,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 2.31.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.5(R-2.10)(12。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 2.3.0),方法,基因组机,,,,艾宾, 平行 |
进口 | EDGER |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,生物基因 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | clusterSeq,,,,rcade,,,,片段,,,,TCC |
进口我 | metaseqr2,,,,riboseqr,,,,Srnadiff |
建议我 | compcoder |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | bayseq_2.31.0.tar.gz |
Windows二进制 | bayseq_2.31.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | bayseq_2.31.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bayseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/bayseq |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/bayseq/ |
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