这是发展沙滩垫的版本;稳定版请参见beachmat.
Bioconductor版本:开发(3.16)
提供一个一致的c++类接口,用于从各种常用的矩阵类型中读取和写入数据。直接支持普通矩阵和一些稀疏/密集矩阵类,第三方S4类可以通过外部链接来支持,而所有其他矩阵都通过DelayedArray块处理。
作者:Aaron Lun [aut, cre], Hervé Pagès [aut], Mike Smith [aut]
维护者:Aaron Lun
引文(从R内,输入引用(“beachmat”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("beachmat")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“beachmat”)
超文本标记语言 | R脚本 | 1.开发人员指南 |
超文本标记语言 | R脚本 | 2.从R矩阵读取数据的c++ (v2) |
超文本标记语言 | R脚本 | 3.将数据写入R个矩阵对象(v2) |
超文本标记语言 | R脚本 | 4.支持任意矩阵类(v2) |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,基础设施,软件 |
版本 | 2.13.2 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | 方法,DelayedArray(> = 0.15.14),BiocGenerics,矩阵,Rcpp |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,rcmdcheck,BiocParallel,HDF5Array |
SystemRequirements | c++ 11 |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | 后面;,BiocSingular,DropletUtils,mumosa,嘘,食物,天窗,单 |
建议我 | bsseq,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,scCB2 |
链接到我 | BiocSingular,bsseq,DropletUtils,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,食物,天窗,单 |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | beachmat_2.13.2.tar.gz |
Windows二进制 | beachmat_2.13.2.zip(64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | beachmat_2.13.2.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beachmat |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/beachmat |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/beachmat/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: