beachmat

DOI:10.18129 / B9.bioc.beachmat

这是发展沙滩垫的版本;稳定版请参见beachmat

编译生物导体处理每个矩阵类型

Bioconductor版本:开发(3.16)

提供一个一致的c++类接口,用于从各种常用的矩阵类型中读取和写入数据。直接支持普通矩阵和一些稀疏/密集矩阵类,第三方S4类可以通过外部链接来支持,而所有其他矩阵都通过DelayedArray块处理。

作者:Aaron Lun [aut, cre], Hervé Pagès [aut], Mike Smith [aut]

维护者:Aaron Lun 的键盘

引文(从R内,输入引用(“beachmat”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("beachmat")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“beachmat”)

超文本标记语言 R脚本 1.开发人员指南
超文本标记语言 R脚本 2.从R矩阵读取数据的c++ (v2)
超文本标记语言 R脚本 3.将数据写入R个矩阵对象(v2)
超文本标记语言 R脚本 4.支持任意矩阵类(v2)
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDataRepresentation基础设施软件
版本 2.13.2
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 方法,DelayedArray(> = 0.15.14),BiocGenerics矩阵Rcpp
链接 Rcpp
建议 testthatBiocStyleknitrrmarkdownrcmdcheckBiocParallelHDF5Array
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
全靠我
进口我 后面;BiocSingularDropletUtilsmumosa食物天窗
建议我 bsseqglmGamPoimbkmeansPCAtoolsscCB2
链接到我 BiocSingularbsseqDropletUtilsglmGamPoimbkmeansPCAtools食物天窗
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 beachmat_2.13.2.tar.gz
Windows二进制 beachmat_2.13.2.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra) beachmat_2.13.2.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beachmat
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/beachmat
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/beachmat/
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