这是发展BigMelon的版本;对于稳定版本,请参阅Bigmelon。
生物导体版本:开发(3.16)
使用GDSFMT使用Illumina阵列的方法。
作者:Tyler J. Gorrie-Stone [CRE,AUT],Ayden Saffari [AUT],Karim Malki [aut],Leonard C. Schalkwyk [aut]
维护者:Tyler J. Gorrie-Stone
引用(从r内,输入引用(“ Bigmelon”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ bigmelon”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ BigMelon”)
R脚本 | BigMelon包 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | CPGISLAND,,,,DNAMETHYLATY,,,,DataImport,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,两通道 |
版本 | 1.23.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3),西瓜(> = 1.25.0),GDSFMT(> = 1.0.4),方法,Minfi(> = 1.21.0),生物酶,,,,甲基菌 |
进口 | 统计,utils,地球,图形,生物基因,,,,Illuminaio |
链接 | |
建议 | 生物基因,,,,运行,,,,生物使用,,,,Minfidata, 平行,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19,,,,Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19,,,,Bumphunter |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | BigMelon_1.23.0.tar.gz |
Windows二进制 | BigMelon_1.23.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | BigMelon_1.23.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigmelon |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/bigmelon |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/bigmelon/ |
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