biobroom

DOI:10.18129 / B9.bioc.biobroom

这是发展生物扫帚版;稳定版请参见biobroom．

将Bioconductor对象转换成整齐的数据帧

Bioconductor版本:开发(3.16)

这个包包含转换生物信息学包构造的标准对象的方法，特别是那些在Bioconductor中的对象，并将它们转换为整齐的数据。因此，它是扫帚包的补充，并遵循相同的整理方法，增加，扫分。整理数据使得重组、重塑和可视化生物信息学分析变得容易。

作者:Andrew J. Bass, David G. Robinson, Steve Lianoglou, Emily Nelson, John D. Storey，由Laurent Gatto贡献

维护者:John D. Storey 和Andrew J. Bass

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("biobroom")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“biobroom”)

超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,MultipleComparison,蛋白质组学,回归,软件
版本	1.29.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证	LGPL
取决于	R (>= 3.0.0)，扫帚
进口	dplyr,tidyr,Biobase
链接
建议	limma,DESeq2,气道,ggplot2,plyr,GenomicRanges,testthat,magrittr,刨边机,qvalue,knitr,data.table,MSnbase,rmarkdown,SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/StoreyLab/biobroom
BugReports	https://github.com/StoreyLab/biobroom/issues
全靠我
进口我	泛太平洋伙伴关系
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	biobroom_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	biobroom_1.29.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	biobroom_1.29.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biobroom
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biobroom
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/biobroom/
软件包下载报告	下载数据