北方

doi:10.18129/b9.bioc.borealis

这是发展Borealis的版本;对于稳定版本,请参阅北方

单位分辨率的Bisulfite-Seq离群值甲基化

生物导体版本:开发(3.16)

Borealis是一个R库,对基于计数的Bisulfite测序数据进行异常分析。它检测到亚硫酸盐测序(BS-Seq)的异常值甲基化的CpG位点。Borealis的核心是建模β-二项式分布。这对于罕见疾病诊断可能很有用。

作者:Garrett Jenkinson [AUT,CRE]

维护者:Garrett Jenkinson

引用(从r内,输入引用(“北方”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ borealis”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“北方”)

html R脚本 北极甲基化检测
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,DNAMETHYLATY,,,,差甲基化,,,,测序,,,,软件
版本 1.1.2
在生物导体中 Bioc 3.15(R-4.2)(<6个月)
执照 GPL-3
要看 r(> = 4.2.0),生物酶
进口 多帕尔,,,,,,,,purrr,,,,plyr,,,,foreach,,,,gamlss,,,,gamlss.dist,,,,BSSEQ, 方法,DSS,,,,r.utils,utils,统计,GGPLOT2,,,,牛仔图,,,,dplyr,,,,rlang,,,,基因组机
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,运行,,,,生物基因,,,,Annotatr,,,,花花公子,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 borealis_1.1.2.tar.gz
Windows二进制 borealis_1.1.2.zip
MacOS 10.13(高山脉) borealis_1.1.2.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/borealis
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/北方
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/borealis/
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