cellTree

这是发展cellTree版本;稳定的发布版本,请参阅cellTree。

推理和可视化的单细胞RNA-seq数据作为一个层次树结构

Bioconductor版本:发展(3.16)

这包计算潜在狄利克雷分配(LDA)单细胞RNA-seq数据和模型构建了一个紧凑的树造型单个细胞在时间和空间之间的关系。

作者:大卫duVerle (aut (cre) Koji津田(aut)

维护人员:大卫duVerle <戴夫在cb.k.u-tokyo.ac.jp >

从内部引用(R,回车引用(“cellTree”)):

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“cellTree”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cellTree”)