cellxgenedp

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellxgenedp

这是发展cellxgenedp的版本;稳定版请参见cellxgenedp．

在细胞基因数据门户中发现和访问单细胞数据集

Bioconductor版本:开发(3.17)

cellxgene数据门户(https://cellxgene.cziscience.com/)提供了以标准方式处理的单细胞序列数据集合的图形用户界面，以“计数矩阵”摘要。cellxgenedp包提供了另一种基于r的接口，允许数据发现、查看和下载。

作者:Martin Morgan [aut, cre]，凯拉·英特多纳托[作者]

维护者:Martin Morgan

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("cellxgenedp")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cellxgenedp”)

超文本标记语言	R脚本	发现和下载数据集和文件从cellxgene数据门户
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,SingleCell,软件,ThirdPartyClient
版本	1.3.1
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	dplyr
进口	httr,旋度,jsonlite， utils，工具，闪亮的,DT,rjsoncons
链接
建议	zellkonverter,SingleCellExperiment,HDF5Array,BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat(> = 3.0.0),嘲笑
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	cellxgenedp_1.3.1.tar.gz
Windows二进制	cellxgenedp_1.3.1.zip
macOS二进制文件(x86_64)	cellxgenedp_1.3.1.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellxgenedp
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cellxgenedp
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/cellxgenedp/
软件包下载报告	下载数据