Chromstar

doi：10.18129/b9.bioc.chromstar

这是发展Chromstar的版本；对于稳定版本，请参阅Chromstar。

CHIP-SEQ数据的组合和差异染色质态分析

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包实现了CHIP-SEQ数据组合和差分分析的功能。它包括单变量和多元峰值电话，导出到基因组浏览器可查看的文件以及用于富集分析的功能。

作者：Aaron Taudt，Maria Colome Tatche，Matthias Heinig，Minh Anh Nguyen

维护者：aaron taudt

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ chromstar”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Chromstar”）

PDF	R脚本	Chromstar用户指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	Atacseq，，，，chipseq，，，，差异词，，，，HiddenMarkovModel，，，，历史化，，，，免疫学，，，，多重组合，，，，峰值探测，，，，测序，，，，软件
版本	1.23.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5.0），基因组机，，，，GGPLOT2，，，，Chromstardata
进口	方法，UTILS，GRDEVICES，图形，统计信息，foreach，，，，多帕尔，，，，生物基因（> = 0.31.6），S4VECTORS，，，，GenomeInfodB，，，，iranges，，，，RESHAPE2，，，，rsamtools，，，，基因组签名，，，，bamsignals，，，，mvtnorm
链接
建议	尼特，，，，生物使用，，，，测试，，，，Biomart
系统要求
增强
URL	https://github.com/ataudt/chromstar
BugReports	https://github.com/ataudt/chromstar/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	chromstar_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	chromstar_1.23.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	chromstar_1.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chromstar
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/chromstar
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/chromstar/
软件包下载报告	下载统计