西塞罗

doi：10.18129/b9.bioc.cicero

这是发展Cicero的版本；对于稳定版本，请参阅西塞罗。

从单细胞染色质可访问性数据中预测CIS-CO-访问性

生物导体版本：开发（3.16）

西塞罗（Cicero）计算单细胞染色质可访问性数据的推定顺式调节图。它还扩展了单镜2用于染色质可访问性数据。

作者：Hannah Pliner [AUT，CRE]，Cole Trapnell [AUT]

维护者：hannah pliner hpliner>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ cicero”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Cicero”）

html	R脚本	来自西塞罗网站的小插图
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	Atacseq，，，，蜂窝基，，，，聚类，，，，表观遗传学，，，，结肠管制，，，，遗传学，，，，免疫学，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件
版本	1.15.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 3.5.0），单片，，，，GVIZ（> = 1.22.3）
进口	断言（> = 0.2.0），生物酶（> = 2.37.2），生物基因（> = 0.23.0），Data.Table（> = 1.10.4），dplyr（> = 0.7.4），fnn（> = 1.1），基因组机（> = 1.30.3），GGPLOT2（> = 2.2.1），玻璃（> = 1.8），grdevices，Igraph（> = 1.1.0），iranges（> = 2.10.5），矩阵（> = 1.2-12），方法，并行，plyr（> = 1.8.4），RESHAPE2（> = 1.4.3），S4VECTORS（> = 0.14.7），统计Stringi，，，，Stringr（> = 1.2.0），蒂布尔（> = 1.4.2），花花公子，，，，VGAM（> = 1.0-5），UTILS
链接
建议	AnnotationDbi（> = 1.38.2），尼特，，，，降价，，，，rmarkDown，，，，rtracklayer（> = 1.36.6），测试，，，，VDIFFR（> = 0.2.3），COVR
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	cicero_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	cicero_1.15.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	cicero_1.15.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cicero
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/cicero
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/cicero/
软件包下载报告	下载统计