clustcomp

doi：10.18129/b9.bioc.clustcomp

这是发展ClustComp的版本；对于稳定版本，请参阅clustcomp。

聚类比较软件包

生物导体版本：开发（3.16）

ClustComp是一个软件包，它实现了几种技术，用于比较和可视化不同聚类结果之间的关系，即平面与平面或分层与平面之间的关系。群集之间的这些关系使用加权双图显示，其中节点代表簇，边缘连接了与非空交点的节点对；每个边缘的重量是该相交中元素的数量，并通过边缘厚度显示。Barycentre算法提供了双图的最佳布局，该算法可最大程度地减少交叉数的加权数量。在比较层次结构和非层次聚类的情况下，树状图在不同的高度上修剪，通过通过深度优先搜索探索树，从根部开始。决定根据评分函数的值进行分割，该分支可以基于双图的美学或层次结构和平面聚类之间的相互信息。从两侧的一组簇之间的映射是用贪婪算法构造的，并且可以另外可视化。

作者：Aurora Torrente和Alvis Brazma。

维护者：aurora torrente

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ clustcomp”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ ClustComp”）

PDF	R脚本	ClustComp软件包
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	聚类，，，，基因表达，，，，软件，，，，可视化
版本	1.25.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6年）
执照	GPL（> = 2）
要看	R（> = 3.3）
进口	SM，统计，图形，grdevices
链接
建议	生物酶，，，，科隆卡，，，，运行，，，，生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	clustcomp_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	clustcomp_1.25.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	clustcomp_1.25.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clustcomp
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/clustcomp
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/clustcomp/
软件包下载报告	下载统计