警戒线

doi：10.18129/b9.bioc.cordon

这是发展Cordon的版本；对于稳定版本，请参阅警戒线。

密码子的使用分析和基因表达的预测

生物导体版本：开发（3.14）

用于分析各种未经注释或KEGG/COG注释的DNA序列中的密码子使用的工具。计算CU偏置和基于CU的基因表达性预测指标的不同度量，并对带注释的序列进行基因集富集分析。实现了可视化Cu和富集分析结果的几种方法。

作者：Anamaria Elek [Cre，Aut]，Maja Kuzman [aut]，Kristian Vlahovicek [aut]

维护者：gmail.com上的anamaria elek

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install（decon ='devel'）Biocmanager :: Install（nastion（“ Cordon”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Cordon”）

html	R脚本	警戒线
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	生物医学信息学，，，，基因表达，，，，遗传，，，，基因烯，，，，遗传学细胞生物学，，，，免疫学，，，，kegg，，，，宏基因组学，，，，途径，，，，软件，，，，可视化
版本	1.11.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（2。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.5）
进口	方法，统计，utils，生物弦，，，，生物酶，，，，dplyr，，，，Stringr，，，，purrr，，，，GGPLOT2，，，，Data.Table
链接
建议	生物使用，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/bioinfohr/cordon
BugReports	https://github.com/bioinfohr/cordon/issues
取决于我
进口我	vhcub
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Cordon_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	CORDON_1.11.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	CORDON_1.11.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cordon
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/警戒线
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/cordon/
软件包下载报告	下载统计