Conumee

doi：10.18129/b9.bioc.conumee

这是发展Conumee的版本；对于稳定版本，请参阅Conumee。

使用Illumina DNA甲基化阵列增强的拷贝数变化分析

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包包含一组使用Illumina 450K或Epic甲基化阵列执行拷贝数变化（CNV）分析的处理和绘图方法。

作者：Marc Zapatka的Volker Hovestadt

维护者：Hovestadt.bio>的Volker Hovestadt

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ Conumee”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Conumee”）

html	R脚本	Conumee
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	库务，，，，DNAMETHYLATY，，，，甲基化array，，，，微阵列，，，，正常化，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，软件
版本	1.31.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（7年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.5.0），Minfi，，，，Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19，，，，Illuminahumanmethylation450Kmanifest，，，，Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19，，，，光照明甲基甲基化epicmanifest
进口	方法，统计，DNACOPIGY，，，，rtracklayer，，，，基因组机，，，，iranges，，，，GenomeInfodB
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Minfidata，，，，rcurl
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	CoperNeutralima
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Conumee_1.31.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）	Conumee_1.31.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/conumee
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/conumee
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/conumee/
软件包下载报告	下载统计