腹带

doi:10.18129/b9.bioc.cummerbund

这是发展康姆斯邦德的版本;对于稳定版本,请参阅腹带

袖扣高通量测序数据的分析,探索,操纵和可视化。

生物导体版本:开发(3.16)

允许持续存储,访问,探索和操纵袖扣高通量测序数据。此外,为常用可视化提供了许多绘图功能。

作者:L。Goff,C。Trapnell,D。Kelley

维护者:忠诚的A. Goff

引用(从r内,输入引用(“康姆斯邦”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ cummerbund”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cummerbund”)

PDF R脚本 Cummerbund用户指南
PDF R脚本 样本Cummerbund工作流程
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 生物信息学,,,,聚类,,,,DataImport,,,,datarepresentation,,,,差异性,,,,基因表达,,,,高通量序列,,,,高通量序列数据,,,,基础设施,,,,多蛋白酶,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,rnaseqdata,,,,软件,,,,可视化
版本 2.39.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(10。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.7.0),生物基因(> = 0.3.2),rsqlite,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2,,,,快速积分,,,,rtracklayer,,,,GVIZ
进口 方法,plyr,,,,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),生物酶
链接
建议 ,,,,plyr,,,,NMFN,,,,Stringr,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,rjson
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cummerbund_2.39.0.tar.gz
Windows二进制 cummerbund_2.39.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) cummerbund_2.39.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cummerbund
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/康姆犬
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cummerbund/
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