达斯珀

doi：10.18129/b9.bioc.dasper

这是发展Dasper的版本；对于稳定版本，请参阅达斯珀。

从RNA测序数据中检测到宽大的剪接事件

生物导体版本：开发（3.16）

达斯珀的目的是从RNA-Seq数据中检测异常的剪接事件。DASPER将用作RNA-Seq的输入和覆盖数据，以计算患者与一组用户定义控件的每个剪接事件的偏差。达斯珀（Dasper）使用无监督的离群检测算法来对患者的每个剪接事件进行评分，其异常得分代表该剪接事件看起来异常的程度。

作者：David Zhang [AUT，CRE]，Leonardo Collado-Torres [CTB]

维护者：David Zhang

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ dasper”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Dasper”）

html	R脚本	达斯珀的简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	替代方案，，，，覆盖范围，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.7.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.0）
进口	蛇怪，，，，Biocfilecache，，，，生物比较，，，，Data.Table，，，，dplyr，，，，GenomeInfodB，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，GGPLOT2，，，，ggpubr，，，，Ggrepel， 网格，iranges，，，，马格里特，，，，Megadepth， 方法，plyranges，，，，readr，，，，网状，，，，rtracklayer，，，，S4VECTORS，，，，Stringr，，，，总结性特征，，，，花花公子
链接
建议	AnnotationFilter，，，，生物使用，，，，COVR，，，，Ensembldb，，，，基因组态，，，，尼特，，，，生命周期，，，，降价，，，，叙事，，，，Refmanager，，，，rmarkDown，，，，SessionInfo，，，，测试，，，，蒂布尔
系统要求
增强
URL	https://github.com/dzhang32/dasper
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/dasper
取决于我
进口我	奥德
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	dasper_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	dasper_1.7.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dasper
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/dasper
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/dasper/
软件包下载报告	下载统计