Deltacapturec

doi：10.18129/b9.bioc.deltacapturec

这是发展Deltacapturec的版本；对于稳定版本，请参阅Deltacapturec。

该软件包发现从3C数据中发现中级染色质重塑

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包从3C数据中发现了中级染色质重塑。3C数据本质上是局部的。它在限制酶消化片段和首选的“观点”区域之间进行了相互作用。通过固定此数据并使用置换测试，该软件包可以测试来自两种细胞类型或两种处理的数据之间的相互作用计数的统计学意义变化。

作者：Michael Shapiro [AUT，CRE]

维护者：迈克尔·夏皮罗

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ delttacapturec”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ deltacapturec”）

html	R脚本	三角洲捕获-C
PDF		参考手册
文本		执照

细节

生物浏览	生物问题，，，，软件，，，，统计信息
版本	1.11.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（2。5年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 3.6）
进口	iranges，，，，基因组机，，，，总结性特征，，，，GGPLOT2，，，，deseq2，，，，Tictoc
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	deltacapturec_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	deltacapturec_1.11.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	deltacapturec_1.11.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deltacapturec
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/deltacapturec
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/deltacapturec/
软件包下载报告	下载统计