diffutr

doi：10.18129/b9.bioc.diffutr

这是发展diffutr的版本；对于稳定版本，请参阅diffutr。

diffutr：简化差分外显子和3'utr使用

生物导体版本：开发（3.16）

DIFFUTR软件包为LIMMA/EDGER/DEXSEQ的差微分箱/外显子使用提供了一个均匀的接口和绘图函数。它还包括Limma :: diffsplice方法的改进版本。最重要的是，DIFFUTR进一步将这些框架的应用扩展到使用Poly-A站点数据库的差异UTR使用分析中。

作者：Pierre-Luc Germain [CRE，AUT]，Stefan Gerber [AUT]

维护者：Pierre-Luc Germain

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ diffutr”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ diffutr”）

html	R脚本	1_diffutr
html	R脚本	diffutr_diffsplice2
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因表达，，，，软件
版本	1.5.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.0）
进口	S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，林玛，，，，EDGER，，，，dexseq，，，，基因组机，，，，rsubread，，，，GGPLOT2，，，，rtracklayer，，，，复杂的图像，，，，Ggrepel，，，，Stringi，方法，统计，GenomeInfodB，，，，dplyr，，，，矩阵，，，，iranges，，，，Ensembldb，，，，Viridislite
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/ethz-ins/diffutr
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	diffutr_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	diffutr_1.5.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	diffutr_1.5.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffutr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/diffutr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/diffutr/
软件包下载报告	下载统计