diffuStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffuStats

这是发展diffuStats版本;稳定发布版本请参见diffuStats．

生物网络上的扩散得分

Bioconductor版本:开发(3.16)

标签传播方法是计算生物学中广泛使用的程序，用于使用网络数据为分子实体提供上下文。节点标签可以来自基因表达、全基因组关联研究、蛋白质结构域或代谢组学分析，它们被传播到网络中的邻居，通过先前的注释知识有效地平滑分数，并优先考虑新的候选者。R包diffuStats包含一系列扩散内核和评分方法，这些方法有助于它们的计算、表征和基准测试。

作者:Sergio Picart-Armada [aut, cre]， Alexandre Perera-Lluna [aut]

维护者:塞尔吉奥·皮卡特-无敌舰队Picart网址:upc.edu b>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #下面初始化BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("diffuStats")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“diffuStats”)

PDF	R脚本	案例研究:预测蛋白质功能
超文本标记语言	R脚本	快速启动
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，遗传学，GenomeWideAssociation，GraphAndNetwork，代谢组学，网络，归一化，蛋白质组学，软件，转录组
版本	1.17.0
在Bioconductor中	BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	grDevices, stats, methods，矩阵，质量，使彻底失败，expm，igraph，Rcpp，RcppArmadillo，RcppParallel，plyr，precrec
链接	Rcpp，RcppArmadillo，RcppParallel
建议	testthat，knitr，rmarkdown，ggplot2，ggsci，igraphdata，BiocStyle，reshape2,跑龙套
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	diffuStats_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	diffuStats_1.17.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	diffuStats_1.17.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/diffuStats
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/diffuStats
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/diffuStats/
软件包下载报告	下载数据