剂量

doi:10.18129/b9.bioc.doser

这是发展剂量的版本;对于稳定版本,请参阅剂量

剂量

生物导体版本:开发(3.16)

Doser软件包是针对性别染色体剂量补偿的下一代测序包,可以广泛地应用于在任意数量的预定基因座组中的基因表达转移。剂量器是用于计数数据的差异基因表达套件,它检测出多种基因的特定基集的表达中的方向变化,系统生物学研究中的广泛效用。剂量器已准备好管理数据的性质和所需的推论集。剂量器使用S4类来存储测序实验中的计数数据。它包含用于标准化和过滤计数数据的功能,以及绘制和计算计数数据的统计数据。它包含用于计数数据线性建模的框架。该软件包已使用真实和模拟数据测试。

作者:AJ Vaestermark,Jr Walters。

维护者:ake.vastermark

引用(从r内,输入引用(“剂量”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ doser”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“剂量”)

html R脚本 剂量
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 datarepresentation,,,,差异性,,,,基因表达,,,,基础设施,,,,测序,,,,软件,,,,系统生物学
版本 1.13.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(3年)
执照 GPL
要看 R(> = 3.6)
进口 EDGER,方法,统计,图形,矩阵,,,,mclust,,,,LME4,,,,运行,,,,总结性特征,,,,消化,,,,S4VECTORS
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 doser_1.13.0.tar.gz
Windows二进制 doser_1.13.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) doser_1.13.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/doser
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/剂量器
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/doser/
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