这是发展Drawproteins的版本;对于稳定版本,请参阅绘制蛋白。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包从UniProt API输出中汲取蛋白质原理图。从GET命令返回的JSON中,它可以从UniProt功能API中创建一个数据框。然后,基于GGPLOT2和基础R的Geoms可以使用该数据框架来绘制蛋白质原理图。
作者:Paul Brennan [AUT,CRE]
维护者:Paul Brennan
引用(从r内,输入引用(“ drawproteins”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ drawproteins”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ drawproteins”)
html | R脚本 | 使用DrawProteins |
html | R脚本 | 在drawproteins中使用Extract_transcripts |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 功能性预测,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.17.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(4年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | GGPLOT2,,,,httr,,,,dplyr,,,,readr,,,,花花公子 |
链接 | |
建议 | COVR,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/brennanpincardiff/DrawProteins |
BugReports | https://github.com/brennanpincardiff/drawproteins/issues/new |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | drawproteins_1.17.0.tar.gz |
Windows二进制 | drawproteins_1.17.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | drawproteins_1.17.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drawproteins |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/drawproteins |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/drawproteins/ |
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