绘制蛋白

doi:10.18129/b9.bioc.drawproteins

这是发展Drawproteins的版本;对于稳定版本,请参阅绘制蛋白

包装从Uniprot API输出中绘制蛋白质原理图

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包从UniProt API输出中汲取蛋白质原理图。从GET命令返回的JSON中,它可以从UniProt功能API中创建一个数据框。然后,基于GGPLOT2和基础R的Geoms可以使用该数据框架来绘制蛋白质原理图。

作者:Paul Brennan [AUT,CRE]

维护者:Paul Brennan >

引用(从r内,输入引用(“ drawproteins”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ drawproteins”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ drawproteins”)

html R脚本 使用DrawProteins
html R脚本 在drawproteins中使用Extract_transcripts
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 功能性预测,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化
版本 1.17.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 4.0)
进口 GGPLOT2,,,,httr,,,,dplyr,,,,readr,,,,花花公子
链接
建议 COVR,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/brennanpincardiff/DrawProteins
BugReports https://github.com/brennanpincardiff/drawproteins/issues/new
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 drawproteins_1.17.0.tar.gz
Windows二进制 drawproteins_1.17.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) drawproteins_1.17.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drawproteins
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/drawproteins
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/drawproteins/
软件包下载报告 下载统计

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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户