富集

doi：10.18129/b9.bioc.enrichplot

这是发展富集版的版本；对于稳定版本，请参阅富集。

功能富集结果的可视化

生物导体版本：开发（3.16）

“富集”软件包实现了几种可视化方法，以解释从ORA或GSEA分析获得的功能富集结果。它主要设计用于使用“ ClusterProfiler”套件套件。所有可视化方法都是基于“ GGPLOT2”图形开发的。

作者：广琴Yu [AUT，CRE]，Erqiang Hu [CTB]

维护者：gmail.com> guangchuang yu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ enrichplot”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“富集”）

html		富集
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，去，，，，基因烯，，，，kegg，，，，途径，，，，软件，，，，可视化
版本	1.17.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（4年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.5.0）
进口	剧情，，，，剂量（> = 3.16.0），GGPLOT2，，，，ggraph，图形，网格，Igraph， 方法，plyr，，，，purrr，，，，rcolorbrewer，，，，RESHAPE2，统计，utils，散落，，，，阴影文本，，，，Gosemsim，，，，马格里特，，，，格特里，，，，Yulab.utils（> = 0.0.4）
链接
建议	clusterProfiler，，，，dplyr，，，，EUROPEPMC，，，，ggupset，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，org.hs.eg.db，，，，Prettydoc，，，，蒂布尔，，，，花花公子，，，，GGFORCE，，，，AnnotationDbi，，，，ggplotify，，，，Ggridges，grdevices，栅格，，，，ggnewscale，，，，Ggrepel（> = 0.9.0），GGSTAR，，，，树，，，，秤，，，，tidytree，，，，rlang，，，，GGTREEEXTRA，，，，tidydr
系统要求
增强
URL	https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/
BugReports	https://github.com/guangchuangyu/enrichplot/issues
取决于我	Maendtoend
进口我	Chipseeker，，，，clusterProfiler，，，，碎片器，，，，Exphuntersuite，，，，Mageckflute，，，，网眼，，，，微生物组合器，，，，多方，，，，Reactomepa
建议我	甲基，，，，Pareg
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	EnrichPlot_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	enrichplot_1.17.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	EnrichPlot_1.17.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichplot
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/enrichplot
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/enrichplot/
软件包下载报告	下载统计