epigenomix

DOI:10.18129 / B9.bioc.epigenomix

这是发展epigenomix版本;稳定的发布版本,请参阅epigenomix。

表观遗传和基因转录与混合模型数据标准化和集成

Bioconductor版本:发展(3.16)

一个包的综合分析RNA-seq或基于微阵列的基因转录和组蛋白修饰ChIP-seq获得的数据。包提供了数据预处理方法和匹配以及贝叶斯混合模型拟合的方法来检测基因与数据类型之间的差异。

作者:汉斯Klein,马丁Schaefer

维护人员:汉斯克莱因< h。克莱恩在uni-muenster.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“epigenomix”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“epigenomix”)

PDF	R脚本	epigenomix包装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,分类,DifferentialExpression,GeneExpression,软件
版本	1.37.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(9年)
许可证	LGPL-3
取决于	R(> = 3.5.0)、方法Biobase,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,SummarizedExperiment
进口	BiocGenerics,MCMCpack,Rsamtools平行,GenomeInfoDb,beadarray
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	epigenomix_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	epigenomix_1.37.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	epigenomix_1.37.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epigenomix
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epigenomix
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/epigenomix/
包下载报告	下载数据