这是发展Epistack的版本;对于稳定版本,请参阅Epistack。
生物导体版本:开发(3.16)
Epistack包装的主要目的是基因组轨道的堆栈(例如但不限于以基因组区域为中心的ChIP-Seq,Atac-Seq,DNA甲基化或基因组保护数据)的可视化。
作者:Saci Safia [Aut],Devailly Guillaume [Cre]
维护者:Devailly Guillaume
引用(从r内,输入引用(“ epistack”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ epistack”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Epistack”)
html | R脚本 | 使用epistack |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | chipseq,,,,基因表达,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,软件 |
版本 | 1.3.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.14(R-4.1)(1年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 4.1) |
进口 | 基因组机,,,,总结性特征,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,Viridislite,图形,plotrix,grdevices,统计,方法 |
链接 | |
建议 | 测试(> = 3.0.0),生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,富集图,,,,Biomart,,,,rtracklayer,,,,COVR,,,,VDIFFR,,,,魔术 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | epistack_1.3.0.tar.gz |
Windows二进制 | epistack_1.3.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | epistack_1.3.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epistack |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/epistack |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/epistack/ |
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