Epistack

doi:10.18129/b9.bioc.epistack

这是发展Epistack的版本;对于稳定版本,请参阅Epistack

来自表观遗传信号的堆栈轮廓的热图

生物导体版本:开发(3.16)

Epistack包装的主要目的是基因组轨道的堆栈(例如但不限于以基因组区域为中心的ChIP-Seq,Atac-Seq,DNA甲基化或基因组保护数据)的可视化。

作者:Saci Safia [Aut],Devailly Guillaume [Cre]

维护者:Devailly Guillaume > gdevailly>

引用(从r内,输入引用(“ epistack”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ epistack”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Epistack”)

html R脚本 使用epistack
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 chipseq,,,,基因表达,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,软件
版本 1.3.0
在生物导体中 Bioc 3.14(R-4.1)(1年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 4.1)
进口 基因组机,,,,总结性特征,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,Viridislite,图形,plotrix,grdevices,统计,方法
链接
建议 测试(> = 3.0.0),生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,富集图,,,,Biomart,,,,rtracklayer,,,,COVR,,,,VDIFFR,,,,魔术
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 epistack_1.3.0.tar.gz
Windows二进制 epistack_1.3.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) epistack_1.3.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epistack
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/epistack
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/epistack/
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