EPIVIZRSTANTALLONE

doi:10.18129/b9

这是发展epivizrstandstalone的版本;对于稳定版本,请参阅EPIVIZRSTANTALLONE

在R中运行epiviz交互式基因组数据可视化应用程序

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包将导入epiviz可视化JavaScript应用程序进行基因组数据交互式可视化。“ Epivizrserver”软件包用于提供完全在R中运行的Web服务器。此独立版本允许通过BioConductor软件包提供的基因组注释浏览任意基因组。

作者:Hector Corrada Bravo,Jayaram Kancherla

维护者:hector Corrada bravo

引用(从r内,输入引用(“ epivizrstandstalone”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ epivizrance”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Epivizrstandantalone”)

html Epivizrstandarone简介
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 GUI,,,,基础设施,,,,软件,,,,可视化
版本 1.25.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(6年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 3.2.3),epivizr(> = 2.3.6),方法
进口 git2r,,,,Epivizrserver,,,,GenomeInfodB,,,,生物基因,,,,GenomicFeatures,,,,S4VECTORS
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,有机体(> = 1.13.9),mus.musculus,,,,生物酶,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 metavizr
建议我 Sctreeviz
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 epivizrstandation_1.25.0.tar.gz
Windows二进制 epivizrstandation_1.25.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) epivizrstandation_1.25.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrstandstalone
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/epivizrstandstalone
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/epivizrstandantalone/
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