FCCAC

doi：10.18129/b9.bioc.fccac

这是发展FCCAC的版本；对于稳定版本，请参阅FCCAC。

功能典型相关分析以评估核酸测序数据集之间的协方差

生物导体版本：开发（3.16）

对DNA或RNA测序数据集的可变性的计算评估是基因组学的关键步骤，因为它允许评估重复的可重复性，并比较不同的数据集以识别潜在的相关性。FCCAC应用功能性规范相关分析以评估：（i）生物或技术重复的可重复性，以高阶组件分析其共同协方差；（ii）不同数据集之间的关联。FCCAC代表了一种更复杂的方法，它补充了基因组覆盖率的皮尔逊相关性。

作者：Pedro Madrigal [AUT，CRE]

维护者：pedro madrigal

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ fccac”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ FCCAC”）

PDF	R脚本	FCCAC小插图
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	Atacseq，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，表观遗传学，，，，功能基因组学，，，，mnaseseq，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，转录
版本	1.23.1
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 4.2.0），S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机， 网格
进口	FDA，，，，rcolorbrewer，，，，基因组化，，，，GGPLOT2，，，，复杂的图像，grdevices，统计，utils
链接
建议	运行，，，，生物基因，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	fccac_1.23.1.tar.gz
Windows二进制	FCCAC_1.23.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	FCCAC_1.23.1.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fccac
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/fccac
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/fccac/
软件包下载报告	下载统计