FCOEX

doi：10.18129/b9.bioc.fcoex

这是发展FCOEX的版本；对于稳定版本，请参阅FCOEX。

基于FCBF的单细胞的共表达网络

生物导体版本：开发（3.16）

FCOEX软件包实现了一个易于使用的接口，以基于FCBF（基于快速相关的过滤器）算法进行共表达分析。它尤其是为了处理单细胞数据而实施的。发现的模块可用于重新定义细胞群体，未经验证的新基因关联并通过逐个结合来预测基因功能。软件包结构取决于Cemitool软件包，依靠Cemitool的作者设计和编写的代码和代码。

作者：Tiago Lubiana [AUT，CRE]，Helder Nakaya [AUT，THS]

维护者：tiago lubiana

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ fcoex”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ FCOEX”）

html	R脚本	FCOEX：单细胞数据的共表达
html	R脚本	FCOEX：与Seurat集成的单细胞数据的共表达
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因表达，，，，GraphandNetwork，，，，免疫学，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，途径，，，，rnaseq，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学，，，，Mrnamicroarray
版本	1.11.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（2。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.1）
进口	FCBF， 平行，进步，，，，dplyr，，，，GGPLOT2，，，，Ggrepel，，，，Igraph， 网格，间图，，，，Stringr，，，，clusterProfiler，，，，Data.Table，grdevices，方法，网络，，，，秤，，，，sna，utils，统计，Singlecellexperiment，，，，Pathwaypca，，，，矩阵
链接
建议	测试（> = 2.1.0），DevTools，，，，生物管理器，，，，tenxpbmcdata，，，，评分，，，，Schex，，，，栅格，，，，斯克兰，，，，Seurat，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	fcoex_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	fcoex_1.11.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	fcoex_1.11.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fcoex
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/fcoex
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/fcoex/
软件包下载报告	下载统计