flowGraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowGraph

这是发展flowGraph版本;稳定发布版本请参见flowGraph

根据标记频率在流式细胞术数据中识别差异细胞群

Bioconductor版本:开发(3.16)

考虑到细胞群之间的依赖性,在流式细胞术数据中确定最大的差异细胞群;flowGraph计算并绘制给定细胞数量的SpecEnr丰度分数。

作者:Alice Yue [aut, cre]

维护人员:Alice Yue

引用(从R中,输入引用(“flowGraph”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("flowGraph")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“flowGraph”)

超文本标记语言 R脚本 flowGraph
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBasedAssaysFlowCytometryImmunoOncology软件StatisticalMethod可视化
版本 1.5.0
Bioconductor自 BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 4.1)
进口 effsizefurrr未来purrrggiraphggrepelggplot2igraph矩阵matrixStats,统计,跑龙套,visNetworkhtmlwidgets、grDevices、方法stringrstringiRdpackdata.table(> = 1.9.5),gridExtra
链接
建议 BiocStyledplyrknitrrmarkdowntestthat(> = 2.1.0的)
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/aya49/flowGraph
BugReports https://github.com/aya49/flowGraph/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 flowGraph_1.5.0.tar.gz
Windows二进制 flowGraph_1.5.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) flowGraph_1.5.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowGraph
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ flowGraph
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/flowGraph/
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