flowMap

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowMap

这是发展flowMap版本;稳定版请参见flowMap

在流式细胞术数据中绘制细胞群,使用Friedman-Rafsky测试进行交叉样本比较

Bioconductor版本:开发(3.16)

flowMap使用非参数多元统计检验量化多个流式细胞仪样品中细胞群的相似性。该方法能够在多个流式细胞仪样品中绘制不同大小、形状和比例的细胞群。该算法可以合并在任何流式细胞仪工作流程,需要准确量化细胞群之间的相似性。

作者:萧超文,于谦,Richard H. Scheuermann

维护者:Chiaowen Joyce Hsiao < Joyce。xiao1在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“flowMap”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("flowMap")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“flowMap”)

PDF R脚本 流式细胞术数据flowMap-FR绘制细胞群
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews FlowCytometryImmunoOncologyMultipleComparison软件
版本 1.35.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(8.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 3.0.1),ade4(> = 1.5 2),doParallel(> = 1.0.3),abind(> = 1.4.0),reshape2(> = 1.2.2),尺度(> = 0.2.3),矩阵(>= 1.1-4),方法(>= 2.14)
进口
链接
建议 BiocStyleknitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 flowMap_1.35.0.tar.gz
Windows二进制 flowMap_1.35.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) flowMap_1.35.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowMap
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowMap
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/flowMap/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: