funtooNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.funtooNorm

这是发展funtooNorm版本;稳定的发布版本,请参阅funtooNorm。

标准化程序英飞纳姆HumanMethylation450 BeadChip工具包

Bioconductor版本:发展(3.16)

提供了一个功能正常化Illumina公司英人类甲基化450 BeadChip (Illumina公司450 k),纠正组织和/或细胞类型。

作者:西莉亚Greenwood <西莉亚。格林伍德在麦吉尔。ca >,斯捷潘Grinek <斯捷潘。grinek ladydavis。ca >,马克西姆鲟鳇鱼<马克西姆。在mail.mcgill鲟鳇鱼。ca >,凯瑟琳·克莱因<凯萨琳。克莱恩在mail.mcgill.ca >

维修工:凯萨琳克莱因<凯萨琳。克莱恩在mail.mcgill.ca >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“funtooNorm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation,归一化,预处理,软件
版本	1.21.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.4)
进口	请,matrixStats,minfi、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,GenomeInfoDbgrDevices图形,统计数据
链接
建议	prettydoc,minfiData,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	funtooNorm_1.21.0.tar.gz
Windows二进制	funtooNorm_1.21.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉)	funtooNorm_1.21.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funtooNorm
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ funtooNorm
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/funtooNorm/
包下载报告	下载数据