GenetClassifier

doi:10.18129/b9.bioc.genetClassifier

这是发展GenetClassifier的版本;对于稳定版本,请参阅GenetClassifier

使用基因表达曲线对疾病进行分类并建立相关的基因网络

生物导体版本:开发(3.16)

综合软件包可以根据基因表达数据自动训练和验证多级SVM分类器。提供基因标记,其共表达网络的透明选择以及查询分类器的接口。

作者:Sara Aibar,Celia Fontanillo和Javier de Las Rivas。生物信息学和功能基因组学组。癌症研究中心(CIC-IBMCC,CSIC/USAL)。萨拉曼卡。西班牙。

维护者:sara aibar

引用(从r内,输入引用(“ GenetClassifier”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ GenetClassifier”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ GenetClassifier”)

PDF R脚本 GenetClassifier-Vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,差异性,,,,微阵列,,,,软件
版本 1.37.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(9年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.10.1),生物酶(> = 2.5.5),ebarrays,,,,模丝, 方法
进口 E1071,图形,grdevices
链接
建议 白血病,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强 rcolorbrewer,,,,Igraph,,,,信息
URL http://www.cicancer.org
取决于我
进口我 生物加工者,,,,癌症
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 GenetClassifier_1.37.0.tar.gz
Windows二进制 GenetClassifier_1.37.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) GenetClassifier_1.37.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genetclassifier
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/genetClassifier
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/genetclassifier/
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