这是发展基因贡献的版本;对于稳定版本,请参阅基因贡献。
生物导体版本:开发(3.16)
鉴定人类基因组中给定基因组基因源的变异的最可能的基因或基因作用。最基本的功能假设近距离基因是输入基因座,该基因越有可能是致病性的。此外,如果在UCSC .bed文件格式中提供基因组区域(例如EQTL或基因组构象数据),将基因组区域(例如EQTL或基因组构象数据)连接起来的任何经验数据都可以使用。
作者:亚瑟·沃斯特
维护者:Arthur Wuster
引用(从r内,输入引用(“基因归因”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ geneattribution”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“基因贡献”)
html | 小插图标题 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 遗传,,,,Genomewideassociation,,,,基因组变量,,,,SNP,,,,软件,,,,变体 |
版本 | 1.23.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(6年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | |
进口 | utils,基因组机,,,,org.hs.eg.db,,,,生物基因,,,,GenomeInfodB,,,,GenomicFeatures,,,,iranges,,,,rtracklayer |
链接 | |
建议 | txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | geneattribution_1.23.0.tar.gz |
Windows二进制 | geneattribution_1.23.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | geneattribution_1.23.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneattribution |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/吉尼 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/geneattribution/ |
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