这是发展genotypeeval版本;稳定的发布版本,请参阅genotypeeval。
Bioconductor版本:发展(3.16)
需要在gVCF或VCF和报告指标来评估质量的电话。
作者:珍妮弗·汤姆(aut (cre)
维护人员:珍妮弗·汤姆<汤姆。詹妮弗:gene.com >
从内部引用(R,回车引用(“genotypeeval”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“genotypeeval”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“genotypeeval”)
HTML | genotypeeval_vignette.html | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | BatchEffect,DataImport,遗传学,单核苷酸多态性,测序,软件,VariantAnnotation |
版本 | 1.29.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7年) |
许可证 | 文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.4.0),VariantAnnotation |
进口 | ggplot2,rtracklayer,BiocGenerics,GenomicRanges,GenomeInfoDb,IRanges、方法、BiocParallel、图形、统计数据 |
链接 | |
建议 | rmarkdown,testthatSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | genotypeeval_1.29.0.tar.gz |
Windows二进制 | genotypeeval_1.29.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | genotypeeval_1.29.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genotypeeval |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ genotypeeval |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/genotypeeval/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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