GGMSA

doi：10.18129/b9.bioc.ggmsa

这是发展GGMSA的版本；对于稳定版本，请参阅GGMSA。

使用“ ggplot2”绘制多个序列对齐

生物导体版本：开发（3.16）

用于多个序列比对和相关数据的视觉探索工具。使用“ GGPLOT2”支持DNA，RNA和蛋白质序列的MSA。多个序列比对可以很容易地与其他“ ggplot2”图相结合，例如由“ ggtree”，Boxplot，Genome Map等可视化的系统发育树。更多特征：序列徽标，序列束，RNA二级结构和序列重组的检测的可视化。

作者：Lang Zhou [Aut，Cre]，广庆Yu [AUT，THS]，Shuangbin Xu [CTB]，Huina Huang [CTB]

维护者：lang zhou

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ ggmsa”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ GGMSA”）

html	R脚本	GGMSA
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	结盟，，，，注解，，，，乘以quessequealignment，，，，软件，，，，可视化
版本	1.3.3
在生物导体中	Bioc 3.14（R-4.1）（0.5岁）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.1.0）
进口	生物弦，，，，GGPLOT2，，，，马格里特，，，，花花公子，utils，统计，剧情，，，，rcolorbrewer，，，，ggalt，，，，GGFORCE，，，，dplyr，，，，R4RNA，grdevices，Seqmagick，网格，方法，州长，，，，格特里（> = 1.17.1）
链接
建议	GGTREEEXTRA，，，，猿，，，，牛仔图，，，，尼特，，，，生物使用，，，，rmarkDown，，，，readxl，，，，ggnewscale，，，，KableExtra，，，，gggenes，，，，测试（> = 3.0.0）
系统要求
增强
URL	http://yulab-smu.top/ggmsa/
BugReports	https://github.com/yulab-smu/ggmsa/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ggmsa_1.3.3.3.tar.gz
Windows二进制	ggmsa_1.3.3.3.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ggmsa_1.3.3.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggmsa
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ggmsa
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ggmsa/
软件包下载报告	下载统计