ggspavis

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggspavis

这是发展ggspavis版本;稳定发布版本请参见ggspavis．

空间解析转录组数据的可视化功能

Bioconductor版本:开发(3.16)

以SpatialExperiment格式存储的转录组学数据集的空间解析可视化功能。包括从基于斑点(例如10x Genomics Visium)和基于分子(例如seqFISH)的技术平台为数据创建几种类型的图的功能。

作者:卢卡斯·m·韦伯，海伦娜·l·克罗威尔[书]

维护人员:Lukas M. Weber < lukas.web.edu at gmail.com>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ggspavis")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ggspavis”)

超文本标记语言	R脚本	ggspavis概述
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	SingleCell，软件，空间，转录组
版本	1.3.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (R-4.1)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	ggplot2
进口	SpatialExperiment，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，ggside，网格，方法，统计
链接
建议	BiocStyle，rmarkdown，knitr，STexampleData，BumpyMatrix，嘘，食物，uwot，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmweber/ggspavis
BugReports	https://github.com/lmweber/ggspavis/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ggspavis_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	ggspavis_1.3.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ggspavis_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggspavis
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ggspavis
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ggspavis/
包下载报告	下载数据