格特里

doi：10.18129/b9.bioc.ggtree

这是发展GGTREE的版本；对于稳定版本，请参阅格特里。

一个用于可视化树和注释数据的R软件包

生物导体版本：开发（3.16）

“ ggtree”扩展了实现图形语法的“ ggplot2”绘图系统。“ ggtree”设计用于可视化和注释及其带注释数据的系统发育和其他类似树状结构的注释。

作者：广琴Yu [AUT，CRE，CPH]，Tommy Tsan-Yuk Lam [AUT，THS]，Shuangbin Xu [aut]，Lin Li [CTB]，Bradley Jones [CTB]，Justin Silverman [CTB]，Watal M. Iwasaki [CTB]，Yonghe Xia [CTB]，Ruizhu Huang [CTB]

维护者：gmail.com> guangchuang yu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ ggtree”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Ggtree”）

html	R脚本	格特里
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	结盟，，，，注解，，，，聚类，，，，DataImport，，，，乘以quessequealignment，，，，系统发育学，，，，reproducibleresearch，，，，软件，，，，可视化
版本	3.5.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（7年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.5.0）
进口	猿，，，，剧情，，，，dplyr，，，，GGPLOT2（> = 3.0.0），网格，马格里特， 方法，purrr，，，，rlang，，，，GGFUN（> = 0.0.6），Yulab.utils，，，，花花公子，，，，tidytree（> = 0.3.9），树（> = 1.8.0），utils，秤
链接
建议	表情符号，，，，ggimage，，，，ggplotify，，，，阴影文本，grdevices，尼特，，，，Prettydoc，，，，rmarkDown，统计测试，，，，蒂布尔，，，，胶水
系统要求
增强
URL	https://yulab-smu.top/treedata-book/(Book）http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/2041-210x.12628(Paper）
BugReports	https://github.com/yulab-smu/ggtree/issues
取决于我	叮当
进口我	COGEQC，，，，富集，，，，GGMSA，，，，GGTREEEXTRA，，，，lintind，，，，淋巴索，，，，迈维兹，，，，微生物膜标志物，，，，微生物剂量，，，，正差，，，，菲尔，，，，Singlecelltk，，，，SitePath，，，，SystemPipetools，，，，Treekor
建议我	compcoder，，，，Treeandleaf，，，，树，，，，树木化的特殊性，，，，Universalmotif
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ggtree_3.5.0.tar.gz
Windows二进制	ggtree_3.5.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ggtree_3.5.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggtree
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ggtree
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ggtree/
软件包下载报告	下载统计