这是发展GGTREEEXTRA的版本;对于稳定版本,请参阅GGTREEEXTRA。
生物导体版本:开发(3.16)
“ ggtreeextra”扩展了使用“ ggtree”在系统发育树上映射和可视化相关数据的方法。这些相关的数据可以在外部面板上显示,以用“ ggplot2”的语法构建的“ ggtree”构建的圆形布局,风扇布局或其他矩形布局树。
作者:Shuangbin Xu [AUT,CRE],广琴Yu [AUT,CTB]
维护者:Shuangbin Xu
引用(从r内,输入引用(“ ggtreeextra”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ ggtreeextra”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ggtreeextra”)
html | R脚本 | GGTREEEXTRA |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,系统发育学,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.7.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年) |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | |
进口 | GGPLOT2,utils,rlang,,,,ggnewscale,统计格特里,,,,tidytree(> = 0.3.9) |
链接 | |
建议 | 树,,,,GGSTAR,,,,拼布,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Prettydoc,,,,降价,,,,测试(> = 3.0.0),支柱 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/yulab-smu/ggtreeextra/ |
BugReports | https://github.com/yulab-smu/ggtreeextra/issues |
取决于我 | |
进口我 | 微生物剂量 |
建议我 | 富集,,,,GGMSA |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ggtreeextra_1.7.0.tar.gz |
Windows二进制 | GGTREEEXTRA_1.7.0.ZIP(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | ggtreeextra_1.7.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggtreeextra |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ggtreeextra |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ggtreeextra/ |
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