GGTREEEXTRA

doi:10.18129/b9.bioc.ggtreeextra

这是发展GGTREEEXTRA的版本;对于稳定版本,请参阅GGTREEEXTRA

R包装在“ ggtree”的圆形或其他布局上添加几何层

生物导体版本:开发(3.16)

“ ggtreeextra”扩展了使用“ ggtree”在系统发育树上映射和可视化相关数据的方法。这些相关的数据可以在外部面板上显示,以用“ ggplot2”的语法构建的“ ggtree”构建的圆形布局,风扇布局或其他矩形布局树。

作者:Shuangbin Xu [AUT,CRE],广琴Yu [AUT,CTB]

维护者:Shuangbin Xu

引用(从r内,输入引用(“ ggtreeextra”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ ggtreeextra”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ ggtreeextra”)

html R脚本 GGTREEEXTRA
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,系统发育学,,,,软件,,,,可视化
版本 1.7.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 GPL(> = 3)
要看
进口 GGPLOT2,utils,rlang,,,,ggnewscale,统计格特里,,,,tidytree(> = 0.3.9)
链接
建议 ,,,,GGSTAR,,,,拼布,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Prettydoc,,,,降价,,,,测试(> = 3.0.0),支柱
系统要求
增强
URL https://github.com/yulab-smu/ggtreeextra/
BugReports https://github.com/yulab-smu/ggtreeextra/issues
取决于我
进口我 微生物剂量
建议我 富集,,,,GGMSA
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ggtreeextra_1.7.0.tar.gz
Windows二进制 GGTREEEXTRA_1.7.0.ZIP(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) ggtreeextra_1.7.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggtreeextra
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ggtreeextra
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/ggtreeextra/
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