Glmgampoi

doi：10.18129/b9.bioc.glmgampoi

这是发展Glmgampoi的版本；对于稳定版本，请参阅Glmgampoi。

拟合γ-频森广义线性模型

生物导体版本：开发（3.16）

拟合线性模型以过度分散计数数据。该软件包可以估计过度分散并适合矩阵输入的重复模型。它旨在处理大型输入数据集，因为它们通常发生在单细胞RNA-seq实验中。

作者：康斯坦丁·艾尔曼·埃尔特兹[AUT，CRE]，迈克尔·洛夫[CTB]

维护者：constantin ahlmann-teltze

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ glmgampoi”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Glmgampoi”）

html	R脚本	Glmgampoi Quickstart
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	rnaseq，，，，回归，，，，Singlecell，，，，软件
版本	1.9.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（2年）
执照	GPL-3
要看
进口	RCPP，，，，延迟的matrixstats，，，，矩阵，，，，延迟，，，，HDF5Array，，，，总结性特征，，，，生物基因，方法，统计，utils，splines
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo，，，，beachmat
建议	测试（> = 2.1.0），动物园，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，林玛，，，，beachmat，，，，大量的，，，，Statmod，，，，GGPLOT2，，，，长椅，，，，生物比较，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，tenxpbmcdata，，，，muscdata，，，，斯克兰
系统要求	C ++ 11
增强
URL	https://github.com/const-ae/glmgampoi
BugReports	https://github.com/const-ae/glmgampoi/issues
取决于我
进口我	变换Gampoi
建议我	deseq2
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	glmgampoi_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	glmgampoi_1.9.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/glmgampoi
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/glmgampoi
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/glmgampoi/
软件包下载报告	下载统计