石墨

doi：10.18129/b9.bioc.graphite

这是发展石墨的版本；对于稳定版本，请参阅石墨。

途径拓扑环境的图形相互作用

生物导体版本：开发（3.16）

来自KEGG，Panther，Pathbank，PharmGKB，Reactome SMPDB和Wikipathways数据库的途径拓扑的图形对象。

作者：Gabriele销售[CRE]，Enrica Calura [aut]，Chiara Romualdi [aut]

维护者：unipd.it>的Gabriele销售

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ graphite”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“石墨”）

PDF	R脚本	途径拓扑环境的图形相互作用
PDF		代谢物.pdf
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	GraphandNetwork，，，，kegg，，，，代谢组学，，，，网络，，，，途径，，，，Reactome，，，，软件，，，，第三派对人
版本	1.43.0
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（10。5年）
执照	AGPL-3
要看	R（> = 4.2），方法
进口	AnnotationDbi，，，，图形（> = 1.67.1），httr，，，，Rappdirs，统计，utils，图形，rlang
链接
建议	检查员，，，，a4preproc，，，，全部，，，，生物使用，，，，快船，，，，CodeTools，，，，hgu133plus2.db，，，，HGU95AV2.DB，，，，算，，，，尼特，，，，org.hs.eg.db， 平行，R.RSP，，，，RCY3，，，，rmarkDown，，，，Spia（> = 2.2），测试，，，，拓扑结构（> = 1.4.0）
系统要求
增强
URL	https://github.com/sales-lab/graphite
BugReports	https://github.com/sales-lab/graphite/issues
取决于我	波特拉
进口我	DCE，，，，富集兄弟，，，，莫格萨，，，，多人，，，，Reactomepa，，，，ssnappy，，，，Starbiotrek
建议我	快船，，，，Intercellar，，，，代谢物图
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Graphite_1.43.0.tar.gz
Windows二进制	Graphite_1.43.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	Graphite_1.43.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graphite
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/石墨
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/graphite/
软件包下载报告	下载统计