Hiannotator

doi：10.18129/b9.bioc.hiannotator

这是发展hiannotator的版本；对于稳定版本，请参阅Hiannotator。

注释Granges对象的功能

生物导体版本：开发（3.16）

Hiannotator包含一组功能，允许用户用自定义注释集对Granges对象进行注释。该软件包的基本理念是将两个granges对象（查询和主题）带有常见的seqnames（即染色体），并从seqnames中返回相关的注释，并从查询匹配的seqnames和行中的行（即基因或cpg群岛）中的行。）。该软件包带有三种类型的注释函数，它们计算出查询的位置是否为：在功能，靠近功能或定义窗口大小中的计数功能。此外，每个功能都配备了并行后端，以利用foreach软件包。此外，该软件包还配备了包装器功能，该功能找到了从通用数据框架制作Granges对象所需的适当列。

作者：nirav v malani

维护者：nirav v malani

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ hiannotator”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Hiannotator”）

html	R脚本	使用hiannotator
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，软件
版本	1.31.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（7。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	基因组机，R（> = 2.10）
进口	foreach，，，，迭代器，，，，rtracklayer，，，，dplyr，，，，BSGENOME，，，，GGPLOT2，，，，秤， 方法
链接
建议	尼特，，，，多帕尔，，，，测试，，，，生物基因，，，，降价
系统要求
增强
URL
取决于我	Hireadsprocessor
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	hiannotator_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	hiannotator_1.31.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	hiannotator_1.31.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hiannotator
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/hiannotator
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/hiannotator/
软件包下载报告	下载统计