Illuminaio

doi:10.18129/b9.bioc.illuminaio

这是发展Illuminaio的版本;对于稳定版本,请参阅Illuminaio

解析Illumina微阵列输出文件

生物导体版本:开发(3.16)

解析Illumina的微阵列输出文件的工具,包括IDAT。

作者:Keith Baggerly [Aut],Henrik Bengtsson [AUT],Kasper Daniel Hansen [Aut,Cre],Matt Ritchie [Aut],Mike L. Smith [Aut],Tim Triche Jr. [CTB]

维护者:gmail.com上的Kasper Daniel Hansen

引用(从r内,输入引用(“ Illuminaio”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ Illuminaio”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Illuminaio”)

PDF 加密IDAT格式的描述
PDF R脚本 Illuminaio简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,基础设施,,,,微阵列,,,,专有Platratforms,,,,软件
版本 0.39.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(9年)
执照 GPL-2
要看
进口 基础64
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,光明(> = 1.0.2),生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/henrikbengtsson/illuminaio
BugReports https://github.com/henrikbengtsson/illuminaio/issues
取决于我 EGSEA123,,,,标准化450k,,,,rnbeads,,,,西瓜
进口我 Beadarray,,,,Bigmelon,,,,冠军,,,,crlmm,,,,enmix,,,,甲基菌,,,,Minfi,,,,芝麻
建议我 林玛
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Illuminaio_0.39.0.tar.gz
Windows二进制 Illuminaio_0.39.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Illuminaio_0.39.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/illuminaio
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/Illuminaio
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/illuminaio/
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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户