校正

doi：10.18129/b9.bioc.infercnv

这是发展Aquelcnv的版本;对于稳定版本，请参阅校正。

从单细胞RNA-seq数据中推断拷贝数变化

生物导体版本：开发（3.16）

使用单细胞RNA-seq表达来可视化细胞中的CNV。

作者：蒂莫西（Timothy Tickle）[aut]，itay tirosh [aut]，Christophe Georgescu [aut，Cre]，Maxwell Brown [aut]，Brian Haas [aut]

维护者：broadinstitute.org>的Christophe Georgescu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ suffcnv”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ undercnv”）

html	R脚本	可视化单细胞RNA-seq表达数据中的大规模拷贝数变化
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	贝叶斯，，，，库务，，，，遗传学，，，，基因组变量，，，，HiddenMarkovModel，，，，Singlecell，，，，软件，，，，统计信息，，，，结构变化，，，，转录组学，，，，变体挖出
版本	1.13.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（3年）
执照	bsd_3_clause +文件执照
要看	R（> = 4.0）
进口	图形，grdevices，rcolorbrewer，，，，GPLOTS，，，，徒劳，统计，utils，方法，猿，，，，植物，，，，矩阵，，，，快速积分，，，，贵族，，，，dplyr，，，，Hiddlemarkov，，，，GGPLOT2，，，，EDGER，，，，硬币，，，，表情，，，，消化，，，，拉恩，，，，莱顿，，，，重塑，，，，rjags，，，，fitdistrplus，，，，未来，，，，foreach，，，，多帕尔，，，，生物基因，，，，总结性特征，，，，Singlecellexperiment，，，，花花公子， 平行，结尾，，，，栅格，，，，argparse
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试
系统要求	jags 4.x.y
增强
URL	https://github.com/broadinstitute/infercnv/wiki
BugReports	https://github.com/broadinstitute/infercnv/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	unwercnv_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	unwercnv_1.13.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/infercnv
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/undercnv
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/infercnv/
软件包下载报告	下载统计