m6Aboost

DOI:10.18129 / B9.bioc.m6Aboost

这是发展m6Aboost版本;稳定版请参见m6Aboost．

m6Aboost

Bioconductor版本:开发(3.16)

这个包可以帮助用户在自己的miCLIP2数据上运行m6Aboost模型。该包包含分配读取计数和获取运行m6Aboost模型的特性的函数。miCLIP2数据应该存储在GRanges对象中。更多细节可以在小插图中找到。

作者:周游[aut, cre]，凯西·扎纳克[au]

维护者:You Zhou

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("m6Aboost")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“m6Aboost”)

超文本标记语言	R脚本	m6Aboost小插曲
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	表观遗传学，ExperimentHubSoftware，遗传学，测序，软件
版本	1.3.0
在Bioconductor	bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	S4Vectors，adabag，GenomicRanges， r (>= 4.1)
进口	dplyr，rtracklayer，BSgenome，Biostrings， utils，方法，IRanges，ExperimentHub
链接
建议	knitr，rmarkdown，bookdown，testthat，BiocStyle，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ZarnackGroup/m6Aboost
BugReports	https://github.com/ZarnackGroup/m6Aboost/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	m6Aboost_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	m6Aboost_1.3.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	m6Aboost_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/m6Aboost
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/m6Aboost
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/m6Aboost/
软件包下载报告	下载数据