meshr

DOI:10.18129 / B9.bioc.meshr

这是发展meshr的版本;稳定版请参见meshr

进行MeSH富集分析的工具

Bioconductor版本:开发(3.16)

一组注释映射,描述使用来自MeSH的数据组装的整个MeSH。

作者:Tsuyuzaki Koki, Itoshi二阶堂,Gota Morota

维护人员:Koki Tsuyuzaki

引文(从R内,输入引用(“meshr”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("meshr")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“meshr”)

超文本标记语言 R脚本 来自BioC 3.14的annotationhub风格的MeSH ORA框架
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释AnnotationData生物信息学FunctionalAnnotationMeSHDbMultipleComparisons软件统计数据
版本 tripwire
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.1.0)
进口 减价rmarkdownBiocStyleknitr,方法,统计,utils,fdrtoolMeSHDbi类别S4VectorsBiocGenericsRSQLite
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/rikenbit/meshr/issues
全靠我
进口我 scTensor
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 meshr_2.3.0.tar.gz
Windows二进制 meshr_2.3.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) meshr_2.3.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/meshr
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/meshr
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/meshr/
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