这是发展AmodomicSworkBenchr的版本;对于稳定版本,请参阅代谢组工厂。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包提供了与代谢台工作台Restful API接口的功能。可以使用API搜索研究,化合物,蛋白质和基因信息。还包括以常见的生物导体格式获得研究数据的方法,例如总结性特征和多亚sayExexperiment。
作者:Gavin Rhys Lloyd [Aut,Cre],Ralf Johannes Maria Weber [AUT]
维护者:Gavin Rhys Lloyd
引用(从r内,输入引用(“代谢组工程”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ agerabolomicsworkbenchr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
BrowseVignettes(“代谢组工程”)
html | R脚本 | 使用structToolbox的示例 |
html | R脚本 | 简介_TO_TO_METABOLOMICSWORKBENCHR |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 代谢组学,,,,软件 |
版本 | 1.7.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | Data.Table,,,,httr,,,,jsonlite, 方法,多亚sayExexperiment,,,,结构,,,,总结性特征,UTILS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,COVR,,,,尼特,,,,HDF5Array,,,,rmarkDown,,,,structToolbox,,,,测试,,,,PMP, 网格,PNG |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | Fobitools |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | 代谢组工程benchr_1.7.0.tar.gz |
Windows二进制 | 代谢组合benchr_1.7.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | 代谢组合benchr_1.7.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabolomicsworkbenchr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/Amagolomicsworkbenchr |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/metabolomicsworkbenchr/ |
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