代谢组工厂

doi:10.18129/b9.bioc.bemabolomicsworkbenchr

这是发展AmodomicSworkBenchr的版本;对于稳定版本,请参阅代谢组工厂

R的代谢组学工作台

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包提供了与代谢台工作台Restful API接口的功能。可以使用API​​搜索研究,化合物,蛋白质和基因信息。还包括以常见的生物导体格式获得研究数据的方法,例如总结性特征和多亚sayExexperiment。

作者:Gavin Rhys Lloyd [Aut,Cre],Ralf Johannes Maria Weber [AUT]

维护者:Gavin Rhys Lloyd

引用(从r内,输入引用(“代谢组工程”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ agerabolomicsworkbenchr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

BrowseVignettes(“代谢组工程”)

html R脚本 使用structToolbox的示例
html R脚本 简介_TO_TO_METABOLOMICSWORKBENCHR
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 代谢组学,,,,软件
版本 1.7.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 4.0)
进口 Data.Table,,,,httr,,,,jsonlite, 方法,多亚sayExexperiment,,,,结构,,,,总结性特征,UTILS
链接
建议 生物使用,,,,COVR,,,,尼特,,,,HDF5Array,,,,rmarkDown,,,,structToolbox,,,,测试,,,,PMP, 网格,PNG
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 Fobitools
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 代谢组工程benchr_1.7.0.tar.gz
Windows二进制 代谢组合benchr_1.7.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) 代谢组合benchr_1.7.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabolomicsworkbenchr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/Amagolomicsworkbenchr
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/metabolomicsworkbenchr/
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